Zawiera głównie tłuszcze nasycone, które w dużych ilościach występują również w maśle i czerwonym mięsie. Podobnie jak inne tłuszcze nasycone, olej kokosowy podnosi poziom cholesterolu LDL, powszechnie znanego jako „zły” cholesterol, który jest powiązany ze zwiększonym ryzykiem chorób serca.