Bakterie w jelicie grubym wytwarzają również niektóre ważne substancje, takie jak witamina K, która odgrywa ważną rolę w krzepnięciu krwi. Bakterie te są niezbędne do prawidłowego funkcjonowania jelit, a niektóre choroby i antybiotyki mogą zaburzyć równowagę między różnymi typami bakterii w jelicie grubym.